Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERC3Q15034 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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