Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCAPHQ15003 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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NCAPHQ15003 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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