Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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COL19A1Q14993 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COL19A1Q14993 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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COL19A1Q14993 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
COL19A1Q14993 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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