Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMCO1Q147U7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SMCO1Q147U7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMCO1Q147U7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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