Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SSPNQ14714 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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