Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE1CQ14123 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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