Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL9A3Q14050 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL9A3Q14050 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL9A3Q14050 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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COL9A3Q14050 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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COL9A3Q14050 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL9A3Q14050 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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