Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGB1Q14028 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB1Q14028 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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