Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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