Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ALCAMQ13740 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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