Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DNASE1L3Q13609 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms