Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PEX6Q13608 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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PEX6Q13608 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX6Q13608 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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