Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNW1Q13573 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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