Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1orf61Q13536 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms