Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PICALMQ13492 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms