Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SKP2Q13309 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKP2Q13309 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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