Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC3Q13217 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DNAJC3Q13217 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms