Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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NR1H3Q13133 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NR1H3Q13133 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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NR1H3Q13133 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NR1H3Q13133 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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