Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IFT88Q13099 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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