Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRAF1Q13077 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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TRAF1Q13077 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TRAF1Q13077 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAF1Q13077 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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