Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TP53BP1Q12888 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TP53BP1Q12888 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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TP53BP1Q12888 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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TP53BP1Q12888 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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TP53BP1Q12888 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TP53BP1Q12888 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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