Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CYP4F3Q08477 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms