Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNDQ07001 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms