Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EGR3Q06889 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms