Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms