Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms