Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms