Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms