Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CENPEQ02224 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms