Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC6A3Q01959 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms