Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XPCQ01831 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XPCQ01831 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XPCQ01831 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPCQ01831 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPCQ01831 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XPCQ01831 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XPCQ01831 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XPCQ01831 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms