Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLTCQ00610 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLTCQ00610 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms