Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FANCCQ00597 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms