Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDK16Q00536 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms