Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRB1P82279 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRB1P82279 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CRB1P82279 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CRB1P82279 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRB1P82279 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms