Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HBBP68871 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HBBP68871 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms