Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P63121 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms