Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EDDM3BP56851 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EDDM3BP56851 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms