Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLDN17P56750 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN17P56750 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms