Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP7P55210 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CASP7P55210 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CASP7P55210 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CASP7P55210 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms