Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LIMK2P53671 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms