Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRP9P49458 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms