Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI2P48788 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms