Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTR1BP42025 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms