Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIPAP38571 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIPAP38571 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LIPAP38571 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LIPAP38571 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LIPAP38571 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LIPAP38571 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LIPAP38571 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms