Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTN2P35609 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTN2P35609 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms