Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TSPOP30536 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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