Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARID4AP29374 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID4AP29374 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms