Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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HOXD10P28358 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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HOXD10P28358 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD10P28358 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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