Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMB5P28074 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB5P28074 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms